Le film retrace l'enquête policière sur la disparition et le meurtre en 1995 de Madalyn Murray O'Hair, la leader de l'association American Atheists, qui visait à séparer le pouvoir de l'Église de celui de l'État.
Alexandra et Jessica emménagent dans une nouvelle maison. Une nuit, en revenant de boite, elles s'arrêtent chez une voyante qui annonce à Alexandra des choses troublantes, le lendemain elle ne se souvient plus de cette visite mais commence à percevoir des présences étranges, des objets se déplacent, des stigmates apparaissent sur sa peau. Elle se sent possédée. Par l'entremise du professeur de Jessica un exorciste sera appelé afin de faire sortir l'enfant démon du ventre d'Alexandra...
Avec Pierre Patry, le spectateur pénètre dans l'intimité d'un couvent, chose exceptionnelle au cinéma. En suivant les pas et l'expérience d'une novice, nous découvrons les usages, les règles et le rythme du monastère de le communauté des Servantes de Jésus-Marie, à Hull.
Septembre 2003. À l'occasion de son cinquantième anniversaire, Amma, figure spirituelle de l'Inde, entreprend une grande tournée dans son pays pour y pratiquer notamment son étreinte rituelle, son darshan.
Le film, basé sur deux années d'enquête, montre que des moniales du monde entier ont été et sont victimes d'abus sexuels de la part de supérieurs hiérarchiques. Le cas des pères Thomas Philippe (cofondateur de la communauté de l’Arche) et Marie-Dominique Philippe (fondateur de la communauté Saint-Jean) qui ont violé des religieuses pendant des décennies sans l'intervention de l'Église, est central dans le documentaire.
Au fin fond des Appalaches, la jeune fille d'un pasteur pentecôtiste, Mara, est courtisée par deux hommes : l'un des paroissiens, Garret, et un autre homme qui a quitté l'église, Augie. Son père, Lemuel, dirige une communauté de croyants qui manipulent le venin de serpents afin de montrer leur courage et faire leurs preuves devant Dieu. Enceinte d'Augie, et poussée par les religieux, Mara accepte d'épouser Garret. Un jour, alors qu'il tente de charmer un serpent, un mineur décède. Afin de protéger sa secte, Lemuel demande à Garret de prétendre que les reptiles lui appartiennent. Pendant ce temps, avant son mariage, Mara est auscultée par la mère d'Augie, Hope, qui découvre qu'elle n'est plus vierge et qu'elle porte un enfant en elle. Cette dernière décide de se taire auprès de Lemuel et Garret mais elle oblige son fils à se repentir. Mais l'étau se resserre petit à petit autour du couple interdit, lorsque Augie se fait mordre à son tour et quand Garret surprend sa future épouse avec lui. Alors que son secret est dévoilé à son père et la secte, elle donne son accord pour faire face à son tour à leur tradition meurtrière afin de se purifier.
Alexandre Guérin habite la région lyonnaise. Cadre bancaire épanoui d'une quarantaine d'années, époux d'une femme aimante et père de cinq enfants, c'est un catholique pratiquant, tout comme sa famille. Un jour, après une conversation avec un camarade jadis scout comme lui, il se rappelle les abus sexuels dont, enfant, il fut victime de la part d'un prêtre pédophile, le père Bernard Preynat. Les faits sont prescrits. Mais, assailli de souvenirs douloureux, Alexandre décide d'entreprendre une enquête. Il entre en contact avec la psychologue de l'archevêché, Régine Maire. Par son entremise, il obtient un rendez-vous avec le cardinal Philippe Barbarin, archevêque de Lyon. Il découvre alors que malgré l'alerte de plusieurs parents, l'Église a étouffé l'affaire. Régine Maire organise une brève confrontation entre Alexandre et le père Preynat, qui se conclut par une prière commune quasi surréaliste. Malgré les nombreux courriers électroniques d'Alexandre, les autorités ecclésiastiques tergiversent et se défaussent. Pire, lors d'une messe, Alexandre constate que le père Preynat, maintenu en fonctions, se trouve toujours au contact d'enfants.
Jeune hippie libre et indépendant, David erre dans une société mercantile qui ne respecte plus ses propres valeurs. Afin de ne pas s'enraciner, il a pris pour habitude de voyager sans véritable but, sur sa moto, à travers tout le pays. Une nuit, il s'arrête afin de porter secours à un quidam qui s'avère être un riche homme d'affaires. Ce dernier, même s'il accepte son aide, lui fait la morale à propos de convictions dénuées de propositions et d'alternatives sociétales, qu'il juge somme toute immatures. Après que sa roue ait été changée, l'homme repart. Alors qu'il constate qu'un pneu de sa moto est crevé, David est témoin de la mort de l'inconnu qui s'est écrasé contre un arbre. Le motard n'a pas d'autre choix que de prendre la fuite.
Jocelyne Khoueiry était une combattante active des milices phalangistes durant la guerre civile libanaise. A la fin de la guerre, elle se repent et se tourne vers Dieu. Jocelyne Saab rentre au Liban pour faire son portrait.
Ce documentaire a la particularité « de confronter directement des victimes de prêtres pédophiles, en caméra cachée, avec leurs agresseurs ». Il « met en cause la hiérarchie épiscopale dans la faiblesse — voire l’absence — des sanctions dans les cas de pédophilie », dénonçant l'hypocrisie de l'église polonaise et l'impunité des prêtres agresseurs.
Le pauvre et aveugle Santi et la tendre Vina sont enfants et très amis. Vina invite Santi à l'école et le protège de la cruauté des autres garçons, en particulier du méchant Krai. Les enfants grandissent. Le père de Santi envoie son fils vivre chez le vénérable bonze de la grotte avec l'espoir que la dévotion à Bouddha créera un miracle et que son fils recouvrera la vue.
En couple depuis trois ans avec Claire, Simone n’a jamais fait son coming out. Entre sa mère ashkénaze qui se donne des claques pour un oui ou pour un non, son père, séfarade traditionaliste toujours au bord de la crise cardiaque, son frère aîné David qui veut la caser avec le cousin de sa future épouse, ou son autre frère Nathaniel, pacsé avec Kevin que la famille n’a jamais accepté, Simone a du mal à exister en plein jour.
Anaïs, étudiante en médecine vit chez sa grand-mère, Isabelle, en Suisse. Celle-ci la reconnaît voilée dans le train. Tout en essayant de comprendre et d'éviter sa radicalisation, Isabelle se souvient qu'elle aussi a été mêlée au terrorisme via le Front populaire de libération de la Palestine et l'attentat du vol Swiss Air 330 le 21 février 1970.